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欧洲引入众包模式助力科学研究
2018/08/24

  欧洲在人类蛋白质图谱位点测定工作中引入众包模式,实施效果良好。

  众包是一个互联网概念,指的是一个公司或机构把过去由员工执行的工作任务,以自由自愿的形式外包给非特定的(而且通常是大型的)大众网络的做法。《自然生物技术》(Nature Biotechnology)杂志2018年9月刊上将披露关于人类蛋白质图谱的研究成果,让人出乎意料的是,在线游戏玩家对该研究成果做出了重要贡献,因而这些游戏玩家也被称为“平民科学家”(citizen scientists)。

  人类蛋白质图谱项目得到了欧洲最大私人基金会之一的瓦伦堡基金会(Knut and Alice Wallenberg Foundation)的支持,由瑞典皇家理工学院负责实施。在项目执行过程中,瑞典皇家理工学院联合了冰岛的大众操控游戏公司(CCP, Crowd Control Productions)和大型多人在线科学计划(Massively Multiplayer Online Science),将需要完成的人类蛋白质图谱测定任务设计成了一个小游戏,并命名为“项目探索”(Project Discovery),然后将该小游戏置入名为《星战前夜》(EVE online,)这一大型在线游戏中,运行期间共有30万“平民科学家”参与游戏并完成了超过3300万个蛋白质亚细胞层级的位点图像分类工作。

  细胞定位分析工具(Loc-CAT ,Localization Cellular Annotation Tool )是第一个可以通过图像多重定位对蛋白质进行注释的通用工具,也是人工智能在图谱测定领域的具体应用。“平民科学家”的参与让这一人工智能技术的作用和成效大为提升,正是借助于人工智能技术和“平民科学家”的力量,科研人员不仅完善了亚细胞层级的蛋白质谱的分类工作,而且首次确认了10个新型棒环结构(rods & rings)的细胞架构。

  目前看来借助众包模式吸引“平民科学家”参与科研项目取得了成功,但仍有改进空间。为了继续做好人类细胞亚细胞层级的蛋白质谱图像分析工作,9月17日科研人员将在Kaggle官网 (https://www.kaggle.com/competitions) 上启动“人类蛋白质图谱2018挑战赛”,将涉及图像分析,以将人类细胞中的亚细胞蛋白质模式分类。并向参与者开出了数千美元的奖金。

  (科技处 贾无志)

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